احداث کارخانه های آجر پزی میتواند باعث ایجاد مشکلات جدی در آن منطقه و همچنین موجودات زنده شود.مهمترین و مخرب ترین آثار کوره های آجر پزی همانطور که گفته شد آلاینده های حاصل از سوخت میباشد.

برداشت منابع برای پخت باعث فرسایش و نابودی خاک آن منطقه میشود . طبق تحقیقات انجام شده توسط دانشمندان در رابطه با هوای دودکش های کارخانه و تطبیق آن ها ، با استاندارد های جهانی محیط زیست و استفاده از نرم افزار SPSS20 بیشترین آثار این کارخانه ذرات سنگین معلق در هوا با وزن 0.667 و تخریب خاک با وزن 0.140 و همچنین رانش زمین با وزن 0.123 کارخانه های آجر پزی را یک بحران جدی برای محیط زیست نام برد.

تاسیس یک کارخانه آجر کوره ای میتواند چالش هایی داشته باشد مانند:

• فضا : برای ایجاد یک کارگاه کوچک شما به فضای بزرگی نیاز دارید شامل فضای دستگاه ، دستگاه برش ، قالب گیر ، کوره  پرسنل و …

• هزینه : هزینه راه اندازی یک کارخانه آجر کوره ای بسیار بالا میباشد و اصلا گزینه مناسبی برای شروع کار نیست.

• پرسنل : برای هر کارخانه کوچک بین 30 تا100 پرسنل و کارگر مورد نیاز میباشد که یکی از بزرگترین چالش ها برای هر کارخانه دار است.
• سلامت : به دلیل تولید آلاینده های سمی و خطرناک سلامت خود و پرسنلتان دائم در خطر است.